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淺析PCR實(shí)驗(yàn)室建造與造價(jià)估算

日期:20-05-20 / 作者: 科瓦特小科 / 出處:科瓦特

 

  PCR實(shí)驗(yàn)室又叫基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室,PCR是聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction)的簡(jiǎn)稱(chēng),。是一種分子生物學(xué)技術(shù),,用于放大特定的DNA片段,,可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。通過(guò)DNA基因追蹤系統(tǒng),,能迅速掌握患者體內(nèi)的病毒含量,,其精確度高達(dá)納米級(jí)別,精確檢測(cè)乙肝病毒在患者體內(nèi)存在的數(shù)量,、是否復(fù)制,、是否傳染,、傳染性有多強(qiáng)、是否必要服藥,、肝功能有否異常改變能及時(shí)判斷病人適合使用哪類(lèi)抗病毒藥物,、判斷藥物療效如何、給臨床治療提供了可靠的檢驗(yàn)依據(jù),。

pcr實(shí)驗(yàn)室

  PCR是分子生物學(xué)研究和實(shí)驗(yàn)的常規(guī)方法,,廣泛應(yīng)用于生物學(xué)各個(gè)領(lǐng)域,例如:艾滋病檢測(cè),、乙型肝炎,、禽疫病、癌基因的檢測(cè)和診斷,,DNA指紋,、個(gè)體識(shí)別、親子鑒定及法醫(yī)物證,,動(dòng),、植物檢疫,動(dòng)物及其衍生產(chǎn)品檢測(cè),,動(dòng)物飼料,、化妝品、食品衛(wèi)生檢測(cè),,轉(zhuǎn)基因作物與轉(zhuǎn)基因微生物檢測(cè)等,。

  平均每1~2年發(fā)生一次傳染病重大疫情,如2003年的重癥急性呼吸綜合征(SARS冠狀病毒),,2005年的禽流感病毒(HSN1禽流感病毒),2008年的手足口(腸道病毒),,2011年的發(fā)熱伴血小板綜合征(新布尼亞病毒),2013年的流感病毒(H7N9病毒),,2014年的禽流感(H10N8病毒)和埃博拉病毒,2015年禽流感病毒(H5N6病毒),,2016年的塞卡病毒,,以及目前的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19病毒)。疫情爆發(fā)突出表現(xiàn)為發(fā)病急,、進(jìn)展快,、傳染性強(qiáng),因而傳染病病原體的快速,、準(zhǔn)確鑒定,,成控制疫情關(guān)鍵因素。此類(lèi)疾病的診斷大部分是通過(guò)核酸擴(kuò)增的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)檢測(cè)的,,而該過(guò)程均需要在高標(biāo)準(zhǔn)的PCR實(shí)驗(yàn)室中由專(zhuān)業(yè)人士操作完成,,因而PCR實(shí)驗(yàn)室在傳染病重大疫情防控中的疾病診斷和服務(wù)成為不可或缺的力量,。除了病毒類(lèi)傳染病,PCR實(shí)驗(yàn)室可開(kāi)展的病原微生物檢測(cè)包括細(xì)菌類(lèi),、真菌類(lèi)以及原生動(dòng)物等疾病的診斷,,如臨床常見(jiàn)的巨細(xì)胞病毒、EB病毒,、結(jié)核分枝桿菌,、甲乙型流感病毒肺炎、支原體及衣原體感染,、乙肝,、丙肝、戊肝等,,PCR實(shí)驗(yàn)室在疾病診斷和控制中起到極為重要的作用,。

  標(biāo)準(zhǔn)的PCR實(shí)驗(yàn)室分為四個(gè)區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、樣品處理區(qū),、核酸擴(kuò)增區(qū),、產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進(jìn)入各個(gè)工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)増反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)各實(shí)驗(yàn)區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應(yīng)通過(guò)傳遞窗進(jìn)行,。

pcr分散區(qū)

  PCR實(shí)驗(yàn)室可以是分散形式,,也可以是組合形式。完成一組PCR實(shí)驗(yàn),,通常應(yīng)經(jīng)過(guò)試劑配制,、樣品處理、核酸擴(kuò)增及產(chǎn)物分析四個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程,。

  1,、分散形式PCR實(shí)驗(yàn)室:

  所謂分散形式PCR實(shí)驗(yàn)室,是指完成上述實(shí)驗(yàn)過(guò)程的實(shí)驗(yàn)用房彼此相距較遠(yuǎn),,呈分散布置形式,。對(duì)于這種布置形式的PCR驗(yàn)室,由于各個(gè)實(shí)驗(yàn)之間不易相互干擾,,因此無(wú)需特殊條件要求,。

  2、組合形式PCR實(shí)驗(yàn)室:

  所謂組合形式PCR實(shí)驗(yàn)室,是指完成PCR四個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程的實(shí)驗(yàn)用房相鄰布置,,組成獨(dú)立實(shí)驗(yàn)區(qū)域的形式,。對(duì)于組合形式PCR實(shí)驗(yàn)室,由于各個(gè)實(shí)驗(yàn)間集中布置,,容易造成相互干擾,,因此,對(duì)總體布局以及屏障系統(tǒng)具有一定的要求。各室在入口處設(shè)緩沖間,,以減少室內(nèi)外空氣交換,。

pcr實(shí)驗(yàn)室

  PCR實(shí)驗(yàn)室主要功能

  1、試劑儲(chǔ)存和準(zhǔn)備區(qū)的功能是:貯存試劑的制備,、試劑的分裝和擴(kuò)增反應(yīng)混合液的準(zhǔn)備,,以及離心管、吸頭等消耗品的貯存和準(zhǔn)備,。貯存試劑和用于標(biāo)本制備的消耗品等材料應(yīng)當(dāng)直接運(yùn)送至試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū),,不能經(jīng)過(guò)擴(kuò)增檢測(cè)區(qū),試劑盒中的陽(yáng)性對(duì)照品及質(zhì)控品不應(yīng)當(dāng)保存在該區(qū),,應(yīng)當(dāng)保存在標(biāo)本處理區(qū),。

  2、標(biāo)本制備區(qū)的功能是:核酸(RNA,、DNA)提取,、貯存及其加入至擴(kuò)增反應(yīng)管。對(duì)于涉及臨床樣本的操作,,應(yīng)符合生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室防護(hù)設(shè)備,、個(gè)人防護(hù)和操作規(guī)范的要求。由于在樣本混合,、核酸純化過(guò)程中可能會(huì)發(fā)生氣溶膠所致的污染,,可通過(guò)在本區(qū)內(nèi)設(shè)立正壓條件,避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染,。為避免樣本間的交叉污染,,加入待測(cè)核酸后,必須蓋好含反應(yīng)混合液的反應(yīng)管,。對(duì)具有潛在傳染危險(xiǎn)性的材料,,必須在生物安全柜內(nèi)開(kāi)蓋,并有明確的樣本處理和滅活程序,。

  3,、核酸擴(kuò)增區(qū)的功能是:DNA合成、DNA擴(kuò)增及檢測(cè),。為避免氣溶膠所致的污染,,應(yīng)當(dāng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的走動(dòng)。必須注意的是,,所有經(jīng)過(guò)檢測(cè)的反應(yīng)管不得在此區(qū)域打開(kāi)。

  4,、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)的功能是:擴(kuò)增片段的進(jìn)一步分析測(cè)定,,如雜交、酶切電泳、變性高效液相分析,、測(cè)序等,。核酸擴(kuò)增后產(chǎn)物的分析方法多種多樣,如膜上或微孔板或芯片上探針雜交方法(放射性核素標(biāo)記或非放射性核素標(biāo)記),、直接或酶切后瓊脂糖凝膠電泳,、聚丙烯酰胺凝膠電泳、Southern轉(zhuǎn)移,、核酸測(cè)序方法,、質(zhì)譜分析等。

  擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)是PCR實(shí)驗(yàn)室主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來(lái)源,,因此應(yīng)注意避免通過(guò)本區(qū)的物品及工作服將擴(kuò)增產(chǎn)物帶出,。在使用PCR-ELISA方法檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),必須使用洗板機(jī)洗板,,廢液必須收集至1mol/LHCl中,,并且不能在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)傾倒,而應(yīng)當(dāng)至遠(yuǎn)離PCR實(shí)驗(yàn)室的地方棄掉,。用過(guò)的吸頭也必須放至1mol/LHCl中浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理,,如焚燒。由于本區(qū)有可能會(huì)用到某些可致基因突變和有毒物質(zhì)如溴化乙錠,、丙烯酰胺,、甲醛或放射性核素等,故應(yīng)當(dāng)注意實(shí)驗(yàn)人員的安全防護(hù),。

  PCR實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)主要依據(jù)及標(biāo)準(zhǔn)

  《醫(yī)療器械生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范附錄體外診斷試劑》,、《醫(yī)療器械生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范體外診斷試劑現(xiàn)場(chǎng)檢查指導(dǎo)原則》條款中,明確對(duì)PCR試劑的生產(chǎn)和檢驗(yàn)環(huán)境做出規(guī)定,。此外現(xiàn)行衛(wèi)生行業(yè)的法規(guī),、標(biāo)準(zhǔn)以及相關(guān)文獻(xiàn)中對(duì)于PCR檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室均作出規(guī)定,主要涉及《全國(guó)臨床檢驗(yàn)規(guī)程》(第三版),、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法》,、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則》及《臨床診斷中聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)的應(yīng)用》等行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的相關(guān)要求。

pcr實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)

  PCR實(shí)驗(yàn)室建設(shè)要點(diǎn)

  1,、主體結(jié)構(gòu)

  主體為潔凈彩鋼板和鋁合金型材,。房間內(nèi)外角均采用鋁合金50內(nèi)圓角鋁,解決了易污染,、積灰,、清洗困難的問(wèn)題。結(jié)構(gòu)牢固,,線條簡(jiǎn)潔美觀大方,,密封性能好。

  2、標(biāo)準(zhǔn)的三區(qū)分隔和壓差控制

  將PCR過(guò)程分為試劑制備,、樣品制備和PCR擴(kuò)增檢測(cè)三個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)區(qū),。整個(gè)區(qū)域有一個(gè)整體緩沖走廊。每個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)區(qū)都有一個(gè)緩沖區(qū),。

  PCR實(shí)驗(yàn)室空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)計(jì)及壓力控制PCR實(shí)驗(yàn)室并沒(méi)有嚴(yán)格的凈化要求,但是為避免各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式,。同時(shí),要嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實(shí)驗(yàn)區(qū)的壓力要求,。

  3,、消毒

  紫外線燈安裝在三個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)、三個(gè)緩沖區(qū)的頂部和轉(zhuǎn)移窗內(nèi)進(jìn)行消毒,。在試劑制備區(qū)和標(biāo)本制備區(qū)還設(shè)置移動(dòng)式紫外線燈,,對(duì)實(shí)驗(yàn)臺(tái)進(jìn)行局部消毒。

  4,、機(jī)械連鎖不銹鋼傳遞窗

  試劑和標(biāo)本通過(guò)機(jī)械聯(lián)鎖不銹鋼(不推薦電子聯(lián)鎖)傳輸窗口傳輸,,確保試劑和標(biāo)本在傳輸過(guò)程中不受污染(人物分流)。

  5,、地面

  地面一般采用PVC卷材地面或自流地板,,整體性好。易清潔,,耐腐蝕,。也可以使用水磨石地面,或大瓷磚(至少800mm×800mm)接縫需要小于2mm,。盡量避免產(chǎn)塵和積塵現(xiàn)象,。

  6、照明

  燈具應(yīng)選用凈化燈具,,便于清潔,、無(wú)塵。

  PCR實(shí)驗(yàn)室主要儀器設(shè)備

  1,、試劑準(zhǔn)備區(qū)儀器設(shè)備主要有冰箱,、超凈臺(tái)、加樣器,、混勻器,、天平和離心機(jī)等,加樣器、天平除了要專(zhuān)用外,還應(yīng)定期校準(zhǔn),。試劑分裝應(yīng)在超凈臺(tái)中進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)混合液應(yīng)使用分子生物學(xué)級(jí)的,試劑制備好后應(yīng)有質(zhì)檢:一是否有污染,、二是檢測(cè)試劑的擴(kuò)增效果;

  2,、標(biāo)本制備區(qū)儀器設(shè)備主要有生物安全柜,、加樣器,、離心機(jī),、溫育儀,、混勻器等;

  3,、擴(kuò)增區(qū)的主要儀器是核酸擴(kuò)增儀,、超凈臺(tái)、微量加樣器,、離心機(jī)可移動(dòng)紫外燈,。擴(kuò)増儀需進(jìn)行校準(zhǔn)。并配備UPS電源,以防止由于電壓的波動(dòng),停電對(duì)擴(kuò)增效果的影響,。

  4,、分析區(qū)所使用的儀器設(shè)備主要有酶標(biāo)儀、洗板機(jī),、加樣器和水浴箱,、DNA測(cè)序儀等。

  PCR實(shí)驗(yàn)室裝修建設(shè)主要造價(jià)估價(jià):

  PCR實(shí)驗(yàn)室對(duì)潔凈和恒溫恒濕有不同需求,,所以一般會(huì)分為以下幾類(lèi):

  1,、對(duì)潔凈度沒(méi)有明確要求的PCR實(shí)驗(yàn)室整體裝修造價(jià)約2500~3000元/㎡;

  2,、潔凈度為十萬(wàn)級(jí)的恒溫恒濕潔凈要求的PCR實(shí)驗(yàn)室整體裝修造價(jià)約3000~4000元/㎡,;

  以上估價(jià)是我公司按以往項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)總結(jié)的大概估價(jià),僅供參考,,其包含內(nèi)容:彩鋼板裝飾裝修,、地面、電氣照明插座,、紫外線滅菌,、空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)、自控系統(tǒng),、實(shí)驗(yàn)家具和給排水等內(nèi)容,。不含實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備、消防和環(huán)保處理部份,。

 
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